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資料1‐2 令和6年度 業務実績概要説明資料 (25 ページ)
出典
公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_59633.html |
出典情報 | 厚生労働省国立研究開発法人等審議会 高度専門医療研究評価部会(第39回 8/5)《厚生労働省》 |
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評価項目1-2
実用化を目指した研究・開発の
推進及び基盤整備
2.ゲノム医療推進基盤整備(メディカルゲノムセンター事業)
認知症等のゲノム医療推進の基盤となるデータベースと解析拠点整備
⚫ アジア最大級の認知症関連オミクスデータベースを整備
⚫ 質の高い臨床情報が付随する認知症関連ゲノム情報
⚫ 認知症のクリニカルシーケンス(CS)対応
⚫ 東アジア初のレビー小体型認知症(DLB)のゲノムワイド関連解析
(GWAS)を実施し新規関連遺伝子を同定
ポ
イ
ン
ト
(1)
解析拠点整備
⚫
⚫
⚫
⚫
45,600人のgenotyping情報(網羅的SNP解析)を格納
4,300人の全ゲノム配列情報を格納
2,600人のトランスクリプトーム情報を格納
1,600人の全エクソーム配列情報を格納
(2)
・バイオバンキングされた試料からゲノム情報を取得し、蓄積
格納されたオミクス情報
• 認知症例を含む342例の全ゲノム解析を実施。累計4,354例となった。
• 網羅的SNP解析は3,284例を実施。累計45,612例と当初目標の
と共有化、研究活用を実施。
・アジア最大級の認知症ゲノム情報資源の保有機関。
20,000例を大きく超えている。
各DBにおける累積データ数
R6年度のCS265症例
H
Omics DB
AD
DLB
FTLD
MCI
VaD
NPH
PD
CN*
その他*
総数
WGS
529
404
97
566
74
84
128
1,808
664
4,354
WES
1,253
5
15
29
3
10
10
182
100
1,607
SNP array
7,117
400
98
2,141
243
130
140
23,631
11,712
45,612
Transcriptome
800
30
0
625
2
2
0
584
569
2,612
(mRNA)
• 格納データを用いて東アジア人
においては初のDLB GWASを実
施し、10番染色体上の新規関連
遺伝子SEC61A2を同定した
コグニサイズ
AI
• 情報の一部はAMEDが管理する公
共のデータベースMGeND、
CANNDsに登録し、データの共有
化(制限共有)に協力。
10番染色体の関連解析結果を拡大した図
スパコンの整備と維持
データサイエンス基盤整備
25
実用化を目指した研究・開発の
推進及び基盤整備
2.ゲノム医療推進基盤整備(メディカルゲノムセンター事業)
認知症等のゲノム医療推進の基盤となるデータベースと解析拠点整備
⚫ アジア最大級の認知症関連オミクスデータベースを整備
⚫ 質の高い臨床情報が付随する認知症関連ゲノム情報
⚫ 認知症のクリニカルシーケンス(CS)対応
⚫ 東アジア初のレビー小体型認知症(DLB)のゲノムワイド関連解析
(GWAS)を実施し新規関連遺伝子を同定
ポ
イ
ン
ト
(1)
解析拠点整備
⚫
⚫
⚫
⚫
45,600人のgenotyping情報(網羅的SNP解析)を格納
4,300人の全ゲノム配列情報を格納
2,600人のトランスクリプトーム情報を格納
1,600人の全エクソーム配列情報を格納
(2)
・バイオバンキングされた試料からゲノム情報を取得し、蓄積
格納されたオミクス情報
• 認知症例を含む342例の全ゲノム解析を実施。累計4,354例となった。
• 網羅的SNP解析は3,284例を実施。累計45,612例と当初目標の
と共有化、研究活用を実施。
・アジア最大級の認知症ゲノム情報資源の保有機関。
20,000例を大きく超えている。
各DBにおける累積データ数
R6年度のCS265症例
H
Omics DB
AD
DLB
FTLD
MCI
VaD
NPH
PD
CN*
その他*
総数
WGS
529
404
97
566
74
84
128
1,808
664
4,354
WES
1,253
5
15
29
3
10
10
182
100
1,607
SNP array
7,117
400
98
2,141
243
130
140
23,631
11,712
45,612
Transcriptome
800
30
0
625
2
2
0
584
569
2,612
(mRNA)
• 格納データを用いて東アジア人
においては初のDLB GWASを実
施し、10番染色体上の新規関連
遺伝子SEC61A2を同定した
コグニサイズ
AI
• 情報の一部はAMEDが管理する公
共のデータベースMGeND、
CANNDsに登録し、データの共有
化(制限共有)に協力。
10番染色体の関連解析結果を拡大した図
スパコンの整備と維持
データサイエンス基盤整備
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