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資料３－３ 西浦先生提出資料 (156 ページ)
出典
| 公開元URL | https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000121431_00348.html |
| 出典情報 | 新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（第92回 7／27）《厚生労働省》 |
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Transient collective immunity を考慮したBA.5流行動態の捕捉の試みについて（東京都）
＜使用モデル＞
Rt=R0*(1-k*cumul/pop)^alpha
ここでR0は基本再生産数、kは累積感染比率のスケーリング、alphaがtransient
collective immunityをもたらす可能性のあるベキ指数
＜使用したデータの期間＞
6/1から7/23まで（累計感染者数の起点は5/16）
※7/25時点のHERSYSデータを使っているため、報告遅れを考慮して7/23まで使用
＜BA.4/5感染者数＞「平滑化スプラインでつなげたBA.4/5の割合 * 報告感染者数」
（ただし感染者数のスムージングはGAMではなく7日間移動平均）
＜BA.4/5割合のデータソース＞健安研発表の変異株PCRスクリーニングの結果から
（健安研検査分＋民間検査分のうちPCR L452R陽性のもの）
https://www.metro.tokyo.lg.jp/tosei/hodohappyo/press/2022/07/20/documents/pre
ss0720-21-01.pdf
＜CI＞parametric bootstrapから算出
＜Empirical Rt＞先週今週比^(2/7)で計算
156
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＜使用モデル＞
Rt=R0*(1-k*cumul/pop)^alpha
ここでR0は基本再生産数、kは累積感染比率のスケーリング、alphaがtransient
collective immunityをもたらす可能性のあるベキ指数
＜使用したデータの期間＞
6/1から7/23まで（累計感染者数の起点は5/16）
※7/25時点のHERSYSデータを使っているため、報告遅れを考慮して7/23まで使用
＜BA.4/5感染者数＞「平滑化スプラインでつなげたBA.4/5の割合 * 報告感染者数」
（ただし感染者数のスムージングはGAMではなく7日間移動平均）
＜BA.4/5割合のデータソース＞健安研発表の変異株PCRスクリーニングの結果から
（健安研検査分＋民間検査分のうちPCR L452R陽性のもの）
https://www.metro.tokyo.lg.jp/tosei/hodohappyo/press/2022/07/20/documents/pre
ss0720-21-01.pdf
＜CI＞parametric bootstrapから算出
＜Empirical Rt＞先週今週比^(2/7)で計算
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